开源软件

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有限元素

• 一些指向开放源代码FEM代码
• 前处理器和后处理器
• Gmsh
  一个三维网格生成器，具有一些CAD和后处理功能。免费的。
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  评级：
• 三角形
  二维三角形单元网格生成器。免费的。
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• 非线性有限元
• CalculiX
  线性/非线性场问题的有限元求解器。免费的。
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  nd在这里
  评级：
• Code_Aster
  
  热力问题的显式/隐式线性/非线性有限元。网站是法语的。可以找到英文简介在这里。免费的。
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  评级：
• 影响
  
  显式非线性有限元代码。有一个简单的预处理器。免费的。
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• OOFEM
  
  固体和一些流体和运输问题的线性/非线性有限元。在布拉格的捷克技术大学开发的。良好的文档。免费的。
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  评级：
  
• 太浩
  
  非线性有限元和网格免费软件从桑迪亚。免费的。
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• Warp3D
  
  伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校固体力学非线性有限元。免费的。
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• FEBio（通过）
  FEBio是一个非线性有限元软件包
  专为解决计算生物力学中的问题而设计。一些
  值得注意的特点包括接触、刚体和运动关节的能力，
  非线性各向异性本构模型，主动收缩模拟;
  孔隙弹性，几乎不可压缩材料的元素公式及其平行
  线性方程组的解。
• 线性有限元
• 埃尔默
  芬兰开发的多物理场有限元软件。免费的。
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• FEMPACK有限元程序
  
  pde的Matlab例程套件通过。
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• FETK
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• OpenFEM
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• 现钞
  用于复杂扫描微结构线性有限元分析的工具。
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• 扩展有限元方法代码；通过。
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• 通用计算数学建模
• FEniCS
  一个大学、国家实验室和工业界之间的联合项目，旨在创建下一代计算框架。包括求解器模块(DOLFIN)、针对变分形式的编译器和优化器(FFC，FErari)，一个象征性的有限元引擎(SyFi)。免费的。
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• GetFEM + +
  一个c++ /Matlab库，提供了各种有限元。GNU公共许可证。免费的。
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• 功能
  一个c++库，为各种有限元素提供基类。免费的。
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• 自适应网格细化和误差估计
• 交易。2
  一个用于自适应有限元分析和误差估计的c++库。免费的。
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常微分方程求解器

• PSIDE
  求解线性ode系统的框架。允许并行解决。
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偏微分方程求解器

• ELLPACK
  求解椭圆偏微分方程的框架。不是真正的开源，需要一个站点许可证
  250美元/年。
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• FIPY
  来自NIST的PDE解决方案框架。
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• JSIM
  从Physiome求解偏微分方程的仿真框架。
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• PDE2D
  二维偏微分方程求解框架。
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Meshfree方法

• 无单元Galerkin Matlab例程
  来自John Dolbow的一维和二维无单元伽辽金(EFG)模拟的Matlab例程。
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• Uintah
  并行c++代码的物质点法计算来自犹他大学。麻省理工学院的许可。可根据要求免费提供。有限的用户文档。
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开源CFD和耦合代码

• CoolFluid
  CFD代码。免费的。
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• FeatFlow
  来自多特蒙德大学的二维和三维不可压缩Navier-Stokes的求解器库和用户界面。免费的。
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• GETDP
  CFD代码。免费的。
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• 多面体
  CFD代码。免费的。
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• LibMesh
  主要用于CFD应用的有限元库。免费的。
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• Uintah
  耦合流固耦合模拟的并行c++代码。对流体使用隐式可压缩欧拉(ICE) CFD代码，对固体使用物质点法。来自犹他大学。麻省理工学院的许可。可根据要求免费提供。有限的用户文档。
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微观结构演化

• 一些指向微观结构演化的开放源代码的指针
• 位错模拟代码
  位错动力学代码。免费的。
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分子动力学/静力学和量子化学

• 生物分子
  • 琥珀色的
    斯克里普斯的分子动力学代码。免费的。
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  • CHARMM；
    分子动力学代码。免费的。
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  • GROMACS，
    分子动力学代码。免费的。
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  • NAMD
    来自UIUC的分子动力学代码。免费的。
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  • NWChem
    分子动力学代码来自PNL。免费的。
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  • 氧自由基吸收
    运行经典生物分子模拟的程序。模拟可以在NVE、NPT、NHP和NVT热力学系统中进行。GPL免费。
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  • 修改
    分子动力学代码来自WUSTL。免费的。
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• 聚合物，金属，气体
  
  • 琥珀色的
    斯克里普斯的分子动力学代码。免费的。
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  • CAMP开放软件项目(CAMPOS)
    来自丹麦的分子动力学和原子模拟代码，用Python编写。GPL许可证(免费的）.原子模拟工具包括:
    • 密度函数码-dacapo
    • 经典MD和准连续体代码尽快
    • 线性松饼轨道代码-LMTO

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  • CHARMM
    分子动力学代码。免费的。
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  • CP2K
    分子动力学代码做原子和分子模拟固态，液体，分子和生物系统。这些方法包括从第一性原理从头开始的密度泛函方法到参数化的经典对势和多体势。免费软件。
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  • DL_POLY
    分子动力学代码来自英国。免费的。
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  • GROMACS
    分子动力学代码主要是为生化分子设计的，比如蛋白质和脂质，它们有很多复杂的键相互作用。在计算非键相互作用(通常主导模拟)方面也很快，并可用于非生物系统的研究，例如聚合物。
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  • LAMMPS，
    桑迪亚的分子动力学代码。免费的。
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  • 林纳德
    惰性气体模拟器。GPL免费。
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  • 分子建模工具包
    分子模拟应用程序库。除了提供现成的标准算法实现之外，MMTK还可以作为一个代码基础，可以很容易地扩展和修改，以处理分子模拟中的标准和非标准问题。GPL免费。
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  • MOSCITO
    由AMBER、OPLS、CHARMM和GROMOS等经典分子力学力场定义的凝聚相体系的分子动力学模拟。GPL免费。
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  • NAMD
    来自UIUC的分子动力学代码。免费的。
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  • NWChem
    分子动力学代码来自PNL。免费的。
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  • ParaDyn
    桑迪亚的分子动力学代码。免费的。
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  • 修改
    序列分子动力学代码。免费的。
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可视化

• SCIRun
  科学可视化软件工具箱来自犹他大学。最先进的体绘制和光线追踪算法。包括一些非常有效的工具。麻省理工学院的许可。
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• AtomEye，
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  评级：
• VMD，
  VMD软件?
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• RasMol，
  光栅化软件?
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• Raster3d
  软渲染软件?
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• MayaVi
  
  一个用Python编写的科学数据可视化工具包。
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• Gnuplot
  
  一种受版权保护但免费分发的绘图软件。
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线性/非线性代数求解

• PETSC
  线性代数方程组的并行解算器。免费的
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• 朋友
  线性代数方程组的并行解算器。免费的
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• 单人可携带的
  线性代数方程组的并行解算器。免费的
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其他人

• 杂项用途守则
  
  对于旋转，莫尔圆，可视化，弹性常数计算等;通过。
• 一些快速求解的指针
• GNU科学图书馆
  
  一个用于一系列数值任务的C/ c++库的集合，对于任何对使用计算机进行科学计算感兴趣的人来说，这是一个必访问的站点。GSL主页还列出了其他语言的相关包、扩展/应用程序和包装器。
• UbuntuScience
  
  一个可以在Linux上运行的软件的综合集合
• NIST软件页面
  
  除此之外，列出的软件包括用于研究多区域气流、水泥基材料的结构和性能、科学可视化、统计分析、非线性建模、可用数学软件指南(交叉索引)和烟羽建模的软件。
• FFTW
  
  离散快速傅里叶变换(FFT)的C子程序库基准测试和便携，fft的选择程序
• Maxima
  
  一个用LISP实现的GPL计算机代数系统，可以进行符号和数值计算(也可以绘图)。除此之外，代码还可以对张量进行符号操作。
• Sage:开源数学软件
  
  一个数学和绘图工具，可以在线使用，也可以安装在WINDOWS、MAC和Linux系统上，它包括与Matlab、Mathematica、Magma等程序的接口，是代数、微积分、初级到高级数论、密码学、数值计算、交换代数、群论、组合学、图论和精确线性代数的学习和教学的开源替代品。

免费/商业软件排名列表

• 结构工程软件数据库从BridgeArt.net。
  
  按名称、类别列出软件。搜索列表。也提供排名。
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