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视觉分子动力学

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利用视觉分子动力学(VMD)可视化LAMMPS分子动力学轨迹

可视化分子动力学(MD)轨迹是非常重要的,因为如果没有适当的可视化工具,分子动力学模拟的许多方面很难识别。MD中的不适当边界条件就是这样一个例子。我使用可视化分子动力学(VMD)来可视化我的MD模拟。我用VMD制作的一些电影如下所示。

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