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用LAMMPS运行MD模拟

Nuwan Dewapriya的照片

在附录A我的博士论文,我分享了一个MATLAB代码来获得石墨烯片中碳原子的坐标。该代码还生成LAMMPS所需的数据文件。此外,我还包含了LAMMPS的样例输入和相应的输出文件。我希望这对那些想学习MD模拟的人有用。

视觉分子动力学(VMD)封装也可用于获得石墨烯的坐标。

评论

你认为用LAMMPS可以获得纳米级压电材料(如PZT)的材料特性吗?

谢谢你!

Farhad米尔

Nuwan Dewapriya的照片

是的,这应该是可能的:http://lammps.sandia.gov/features.html

但是计算成本可能非常高,这取决于模型的大小。我更喜欢用超级计算机来模拟石墨烯片的张力测试,如果它有超过1000个原子。

你好,Dewapriya先生

谢谢你在博客上分享这么有用的信息。我还使用Md模拟工具(material studio)来测定纳米复合材料的力学性能。我在印度做研究。我也想使用LAMMPS,但完全不知道它的操作程序和使用方法,因为它是这个领域的新产品。

你能建议一些参考资料,以便我了解LAMMPS的完整功能吗?我的意思是,给出所需输入,运行模拟,然后从结果中提取所需输出的方法。

谢谢你的帮助。

基肖尔大师

Nuwan Dewapriya的照片

大师先生你好,

有关运行LAMMPS的一些非常有用的资料可在此查阅:https://icme.hpc.msstate.edu/mediawiki/index.php/Atomistic_Deformation_o..。

你也可以看看我的MASc论文的第2.5节:https://circle.ubc.ca/handle/2429/42026

Nuwan

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