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JournalClub2012年3月主题:Brownian运动和变换线程和网络变换弹性

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机械向生物和软物前沿推进需要理解微量和微量以下热波动浮点作用很容易从温度运动均衡生物薄膜中看到, 时间和作用因布朗运动而围绕最小能量配置浮动网络和网格中的丝状物,如Actin、colorin、fribrin或其它生物聚合物等仍然如此微镜尺度中这些丝状物的热运动表现为宏镜尺度中的延缩性文章中我们提出了一个理论 高效计算热机械性能 波动多式线程和网络中心问题在于评价分布函数和自由能量 异式丝状和网络假设 它们的能量可表现为运动变量中的二次函数分析各种边界条件对丝状物波动的影响 并显示结果一致并计算区域扩展模数和剪模数三角网和平方网.此函数说明我们如何将有限元素法与从统计机制到解决热波配置嵌入问题路径技术相结合

附加文件 大小问题
PDF图标NLM_1484.pdf 580.6KB
PDF图标supurohitsoft.pdf 852.92KB

注释

天香图片

亲爱的教授普罗希特

感谢发布日志俱乐部主题 本月

细胞内部高度起伏结构 组织性强可以看到演化线程多起波动, 甚至在下文BiophysJ论文补充Viohttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1989696/bin/biophysj_107.114538_index.html)然而,正是这些起伏不定的线程为细胞提供机械支持或火车持续振动轨迹

热波动用或测量探测这些软丝小小变化相当长一段时间http://www.jbc.org/content/270/19/11437.full.pdf)众所周知热波可显著改变工序精度假设我理解正确,非线性链(marco siggia 1995宏模数)仅因热波动产生换句话说,如果我们关闭温度 蠕虫链只不过是线性弹性泉

据我所知,目前尚不清楚热波对聚合物网络初始变硬作用有多大一些人认为网络的结构和几何性 也能促进僵化热浮动对丝网有重大影响时,上行链路距离与聚合物持久长度相似时,浮动不显著,而其他研究者发现,至少对某些网络而言,热解变异仍然对网络弹性负责,即使交叉链路距离小于持久长度。因此我认为重要的是,我们拥有高效计算工具来理解这些问题。

2012论文ProfessionPurohit附加框架试图综合有限元素法和统计力学来理解环形特效聚合物网络上做有限元素模拟的一些人读到文章时,我想问一下他们使用有限元素包模拟网络的典型大小某些典型自由度似~1000 但我不确定我本人不熟悉使用有限元素包,我还想知道,如果僵化矩阵单数,有限元素模拟会怎么样?仿佛网络中某些丝状物不完全连接他人或网络密度低于渗透阈值,我想象僵硬矩阵单数如何反向僵硬矩阵解决问题

感谢阅读

诚心地

天香苏

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感谢你评论我的文章和论文

实中我们做研究时的观点是 细胞中浮动线 机械支持它 方式与梁框架支持一楼问题没有完全解决取热电流生成的张力微小图解压缩平衡内容模型之精髓关于列车振动轨迹的类比,分子电机至少部分使用热波优待(分秒搜索步骤)沿线移动仿佛实列车轨迹微镜电机转换化学能为机械工作以获取定向运动

第二题涉及非线性 延展线条关系热波动显然是源码之一,如脱氧核糖核酸、Actin和多聚合物中,但还可能有许多其他效果其中一个效果就是压力诱导结构改变在许多丝状分子中都可以看到这一点,包括脱氧核糖核酸、fribrin纤维和某些中间丝状物中也可以看到这一点。

网络压力-压力响应也可能因多种原因产生阻抗伸展热波重新定位直线主方向与紧张相对应是另一个原因交叉链路图中也有交叉链路,对连接线设置约束会影响整体僵硬性

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亲爱的教授浦里江天香

感谢您带出如此有趣的题目我将更仔细地阅读您的论文。我注意到spring网络模型常被多人使用研究生物聚合网络和Gels。你对它有什么评论吗?

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说人们建模聚合物像泉水网络是完全对的类型模型开始出现于1940年代和1950年代springs网络的能量可写成二次形式,分区函数和免费能量很容易使用高斯积分计算棒子和泉水不同线性弹簧在紧张或压缩方面行为相同,而棒扣压缩方法能捕捉棒插入纤维网络可产生有趣的效果,如可逆软化和非affine变形,spring网络模型无法取出方法能捕捉这些特效代价是我们方法半解析 spring网络模型可分析处理

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亲爱的万博manbetx平台感谢在iMechanica发布日志俱乐部上传生物纤维热波动行为很有趣 并有益于理解生物纤维行为

顺便说一下,我想指出测量生物纤维热波动可成为提取这种纤维机械特性的有用工具具体地说,热波和机械特性之间的关系以统计力学理论为基础,该理论显示测量生物纤维变形相关联平均量与机械特性直接相关举例说,柔性生物纤维的热波动行为(例如脱氧核糖核酸、RNA、微核素等都顺从弯曲运动,然后通过测量端对端距离或联结角共生平均度来估计折曲硬度(或持久长度)可发现这种纤维的弯曲硬度(或持久长度)相关引用列表如下:

[1] Pampaloni等al.,“轮接微图热浮动提供依赖长持久长度的证据”,PNAS10310248(2006年)

[2]Rivetti等al.,“扫描力DNA显微镜沉入Mica:统计聚合链理论研究均衡与动脉陷阱学”,J.模尔生物圈264919(1996年)

维京斯等高弹性短尺度脱氧核糖核酸 原子力显微镜检测纳特纳诺切诺尔一号137(2006年)

Valdman等extical分析方法 强健测量生物聚合物弹性硬性生物物理J.1021144(2012)

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亲爱的基尔霍

热运动可用于提取长滑分子机械性能JonathonHoward是这一地区的先驱事实上,这种技术大量用于分子电机研究以确定各种状态的僵硬性引文都很有趣 我和Wiggins et al研究者密切接触造纸

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