范阳的博客

在我们最近的一篇论文中，我们研究了在分子动力学(MD)模拟中应用主动变形的当前方案的能量守恒。具体来说，本文研究了两种方法。一种是通过仿射变换来缩放模拟盒的尺寸和原子位置，适用于周期系统。另一种是移动与系统中原子相互作用的刚性壁，适用于非周期系统。