纳米雕塑:一种为原子模拟生成复杂的真实构型的方法

原子模拟现在在研究材料的变形和破坏方面已经变得司空见惯。近年来，计算能力的提高使得数十亿，甚至数万亿原子的大规模模拟成为可能。然而，到目前为止，大多数模拟仍然是在准2d几何形状或相当简单的3D设置下进行的。虽然对这种定义良好的结构进行对照研究通常需要从原子模拟中获得定量信息，但对于定性研究，例如对机制的识别，研究人员将从一种有助于实现更现实配置的方法中受益匪浅。理想的情况是对实验观察到的结构进行一对一的重建。为此，我们提出了一种名为NanoSCULPT的新方法和软件工具，具有以下特点:•该方法允许从任意形状的三维封闭体积中轻松生成原子模拟的样品。•该工具可用于从人工几何形状中构建原子样品，包括CAD几何形状和从原子模拟以外的模拟方法获得的结构。•该工具能够生成实验信息原子样品，例如通过数字化显微照片或使用断层扫描数据。这篇论文最近发表在开放获取期刊MethodsX上。A. Prakash, M. Hummel, S. Schmauder和E. Bitzek[2016]:纳米模拟:一种生成复杂现实构型的原子模拟方法MethodsX，阅读全文，请点击这里(doi:10.1016/j.mex.2016.03.002)