PyCAC:并发原子连续体模拟环境

http://dx.doi.org/10.1557/jmr.2018.8

摘要

提出了一种新的并发原子连续体(CAC)方法的分布式存储并行实现。主要用Fortran 2008编写，并使用Python脚本接口包装，PyCAC中的CAC模拟器使用带有空间分解算法的消息传递接口并行运行。Python接口建立在底层Fortran代码之上，为用户提供了一种健壮而通用的方式来构建系统配置、运行CAC模拟和分析结果。在本文中，在简要介绍了CAC方法的理论背景之后，我们讨论了动态、准静态和混合CAC的串行算法，以及代码中使用的一些编程技术。然后对并行算法进行了说明，对并行可扩展性进行了量化，并讨论了PyCAC的一些软件规范;更多信息可以在PyCAC用户手册中找到www.pycac.org。