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GROMACS:快速,免费和灵活的MD
星期一,2007-05-07 12:00 -Roozbeh Sanaei
GROMACS是一个多功能的包来执行分子动力学,即模拟
牛顿运动方程的系统有数亿个
粒子。
它主要是为蛋白质和脂类等生化分子设计的
它们有很多复杂的键相互作用,但由于GROMACS是
在计算非键相互作用(通常占主导地位)方面非常快
模拟)许多小组也将其用于非生物的研究
系统,例如聚合物。
有没有人熟悉它的界面与流行
量子化学包(MOPAC, GAMES-UK,高斯)
提供哪些来执行混合MM/QM模拟?
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