万博manbetx平台《准连续体无轨道密度泛函理论:百万原子电子结构(DFT)计算的途径》 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/node/956 对“准连续统无轨道密度泛函理论:百万原子电子结构(DFT)计算的一条途径”的评论 埃齐奥·布鲁诺系 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/9169#comment-9169

对于准连续体无轨道密度泛函理论的回复:数百万原子电子结构(DFT)计算的途径

星期二,2008年11月18日18:56:26 +0000 支持布鲁诺 在//m.limpotrade.com发万博manbetx平台表评论9169 将这种方法扩展到K-S DFT的工作进展如何 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/8880#comment-8880

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亲爱的Vikram

非常有趣的工作。我想知道将这种方法推广到K-S DFT的工作是如何进行的,推广的困难是什么?说实话,我对DFT理论并不熟悉,所以我的问题可能会这么简单。

我阅读了一些关于光子晶体缺陷态的文献,遗憾的是,我们没有取得太大进展,因为一些原因放弃了。然而,我仍然对这个领域很感兴趣,所以我想知道新的想法(特别是那些基于计算/固体力学的想法)。

希望能提前听到您的回复和感谢。

2008年10月11日星期六01:52:07 +0000 腾张 评论8880在https://imechanic万博manbetx平台a.org
回复:有关DFT的进一步问题 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1469#comment-1469

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亲爱的Ajit,

1。我们没有使用FD的原因是

(i) FD不尊重问题的变分结构

(ii)正如你提到的,它不能处理任意的几何和边界

(iii)更重要的是,它不能处理非结构化的粗粒度,这是我们多尺度方案的核心。这样的粗粒度使我们能够使用OFDFT处理数百万个系统,这在目前是不可能的。这种方案在模拟系统中很重要,其中量子尺度和宏观尺度上的物理很重要,例如材料中的缺陷以及您提到的一些应用。更多信息请参考我们的第二篇论文。

每个变分公式都有一个等价的强公式(微分公式),当然假设系统中存在一定的规律性(反之则不成立)。与变分公式相关的偏微分方程是欧拉-拉格朗日方程。所以DFT,特别地,也有一个微分公式。

我最近熟悉一项工作(过去也有一些),其中使用FD方案来离散DFT。参见,“一种有效的无轨道密度泛函理论的实空间方法”,C.J. García-Cervera, Comm。 Comp. Phys., 2 (2), pp. 334-357 (2007).

Regarding Gallerkin formulation, as I mentioned before, a discrete variational formulation and Gallerkin formulation are equivalent (just like a variational formulation, weak-form are equivalent).

2. Yes, the three are related. We can discuss more on personal correspondence if this is not clear. Yes, DFT can handle glass at 0K.

3. Motion can be handled in DFT, though periodicity imposes serious restricions in modelling such systems. The physics of DFT is very fundamental, its the discretization and numerical schemes which pose the challenge.

4. DFT is derived from QM for ground-state properties and has all the features of QM. So, I am speculating it will be able to model the bucky-ball through a small slit though I havent come across this.

2007年3月5日星期一14:14:09 +0000 Vikram Gavini 评论1469在https://imechanic万博manbetx平台a.org
关于DFT-FEM问题的进一步说明 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1462#comment-1462

嗨,Vikram,

是的,答案很有帮助,但有时只是部分。< / p > < p > 1。我提出关于FDM的问题是因为:(I)我喜欢它的简单性!(ii) FEM最重要的优势——在统一框架内更好地处理更复杂的bc的能力——似乎在这里已经缺席了(尽管我不能立即看到原因)。

是否DFT根本没有被表示成一个等价的微分方程?这就是为什么FDM和伽辽金形式的有限元公式到目前为止没有被研究的基本原因吗?

没有DFT的微分公式是出乎意料的,考虑到(i)它是更严格的变分形式,(ii) DFT工作获得了诺贝尔奖,以及(iii)物理学通常的工作方式,因此即使是替代方法的细微差别也不会不追求。可能,但出乎意料。< / p > < p > 2。又是一个愚蠢的问题!在这种情况下,周期性是什么意思?格状规则排列(在实空间中是周期性的)? The particular form of BCs (their symmetry)? The basis in plane-waves (sort of like Fourier expansion)? Do the three have to be related necessarily?... It wouldn't seem to be so on the face of it... Some of my questions also probe these aspects... For instance, let me ask you one more question: You mention non-zero temp. OK. So, can DFT-FEM handle glass at 0 K (as a theoretical scenario)? How about a solid solution with randomly placed second component?

I did note Pradeep Sharma's comment about the freedom from periodicity that your work now allows. So your work does seem to be important. Yet, as an outsider, I can't quite see why the plane-wave basis would be a limitation... Just thinking aloud--you may leave this point alone.

3. Then, my questions also dealt with the aspect of *motion* within the system: whether and how DFT (and its FEM approximation) could handle motion. Yours seems to be a static model. Or is it the case that the inability to handle non-periodic BCs has also meant, so far, the inability to model motion of atoms/ionic cores?

4. Finally, my question on bucky-ball through a narrow slit also probed the power and suitability of the DFT approach to address (i) tunneling and (ii) wave-particle duality of matter. These are the routine problems for QFT folks to ponder on. How does DFT fare here? How well would a DFT-FEM simulation work out here?

In the present post, the question numbers 1 and 4 are more immediately interesting to me than the others.

2007年3月5日星期一06:41:13 +0000 Ajit R. Jadhav 评论1462在https://imechanic万博manbetx平台a.org
回复:关于DFT的一般问题 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1453#comment-1453

亲爱的Ajit,

我在下面简短地回答你的问题。< / p > < p > 1。DFT本身是一个变分公式。它指出“系统的基态性质只取决于电子密度”。这是一个变分表述。现在,有限元法比FD等其他方法更好因为它尊重问题的变分结构。变分公式的离散化版本和相应的Gallerkin公式都得到同一组方程。

2,3,4:其中一些应用是可能的,并且正在尝试中。然而,在您提到的大多数应用程序中存在两个主要障碍。

(i)在大多数这样的应用中,人们需要摆脱周期性,这一直是一个严重的限制,因为大多数DFT代码是使用平面波基编写的。这就是实空间公式有用的地方,它可以处理更一般的非周期系统。

(ii)您提到的一些应用需要在非零温度(更高温度)下进行模拟,这仍然是电子结构计算中的一个圣杯问题。

I hope these answers are useful.

Sun, 04 Mar 2007 16:45:13 +0000 Vikram Gavini 评论1453在https://imechanic万博manbetx平台a.org
关于DFT本身的一般问题 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1445#comment-1445

我在这里贴出一些关于DFT的一般性问题。万博体育平台然而,我想在一开始就指出,DFT不是我的专业知识领域,更不用说研究了。我对DFT的兴趣(到今天为止)主要是出于外行人的好奇心。也许这就是为什么我有很多关于DFT的天真的(甚至是愚蠢的)问题要问。

我把这些问题贴在这里,作为对Vikram帖子的评论,尽管这些并不是对他即将发表的两篇论文的评论。我相信这些论文正是他希望在这里讨论的主要内容。然而,我的这些问题确实与DFT有关。所以,我决定把它们贴在这里…如果这些问题变得足够有趣,任何人都可以随意创建单独的讨论线程并在那里发布它们…我希望Vikram不会介意从他的帖子开始讨论dft相关的观点。

(1.0)为什么人们对DFT使用有限元的变分形式? Two sub-questions...
(1.1) Why do they not use simple FDM (finite difference method)?
(1.2) Why not use Galerkin's method?

(2.0) The difference between DFT and ab initio calculations seems to be well noted in the literature. But what is the main difference between QFT and DFT?
(2.1) Why is DFT not used to analyze superconductivity?

All the following questions have this prefix: "Using the currently available DFT simulation technology..."

(3.0) Can one simulate ordinary liquids, say, water or molten tin or copper? Is there any salient difference between using DFT for solids vs. for liquids?
(3.1) Can one predict thermodynamic quantities like, say, heat of fusion?
(3.2) Can one model nucleation and growth in solidification?

(4.0) Can one model the motion of, say, a small cluster of water molecules against a backdrop of other millions of water molecules?
(4.1) Will it be possible to simulate some liquid passing through a nanotube? Can one think of any major obstacle against modeling this situation--something that would be very obvious to a DFT expert?
(4.2) Will it be possible to simulate a buckyball passing through a narrow slit? Will this simulate diffraction--as has been experimentally observed?

Thanks in advance for all your replies.

2007年3月4日星期日05:39:10 +0000 Ajit R. Jadhav 评论1445在https://imechanic万博manbetx平台a.org
Re: FEM和DFT https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1444#comment-1444

回复FEM和DFT

亲爱的Sukumar,

非常感谢您的评论。我期待着阅读你们的论文。

2007年3月4日,星期日,02:31:30 +0000 Vikram Gavini 评论1444在https://imechanic万博manbetx平台a.org FEM和DFT https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1443#comment-1443

回复准连续体无轨道密度泛函理论:百万原子电子结构(DFT)计算之路< div class="field- name-comment-body field-type-text-long field-label-hidden">

带着兴趣阅读你的论文。非常出色和全面的工作,汇集了来自不同领域的工具和技术,以及高性能计算,试图“弥合规模”。OF-DFT的基本原理得到了很好的解释;我更熟悉使用伪势近似的KS-DFT,以及Gamma/epi收敛的一些元素。根据我在文献中看到的,大多数多尺度方法通常使用经验势,很少像你提出的那样从第一原理开始。我看到有人引用了Pask关于FE-DFT的工作,他是少数几个在自洽KS-DFT计算中开发和应用有限元的人之一。我们目前正在将单位分割有限元应用于薛定谔方程(特征问题),结果非常令人鼓舞(与其他实空间方法甚至是平面波相比)。当论文在未来几个月内实现时,将发布/讨论相同的内容。要创建链接,您可以突出URL(进入编辑),然后单击菜单中的“链”符号,并在那里提供URL。

2007年3月4日星期日01:22:22 +0000 n Sukumar 评论1443在https://imechanic万博manbetx平台a.org
回复:很有趣 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1424#comment-1424

回复非常有趣< div class="field- name-comment-body field-type-text-long field-label-hidden">

亲爱的Pradeep,

谢谢!针对您的问题-

(1)我们已经开发了无轨道密度泛函理论(OFDFT)的QC方法。对于电子结构接近自由电子气体的系统(如铝、简单金属等),OFDFT是一种可靠的计算工具,但对于共价键系统,OFDFT可能会给出错误的结果。因此,在这一点上,我们不能研究半导体器件。对于任何材料,最可靠的计算工具是密度泛函理论(KS-DFT)的Kohn-Sham版本。我正致力于扩展目前的方法来实现KS-DFT的粗粒度化。一旦这样做了,那么我们就可以访问所有材料和所有属性(结构,光学,电子,磁…)

(2)迄今为止开发的标准准连续体代码只处理位移场的粗粒化。但在离散傅里叶变换中,我们也需要对电场进行粗粒化处理,这是非平凡的。在我们的第二篇手稿中,标题为“准连续体无轨道密度泛函理论:数百万原子DFT计算的途径”(在JMPS网站上有文章,我的博客上也有链接),我们展示了我们是如何实现这一目标的。简而言之,我们使用了一种预测校正方法,并构建了一个由Lions等人的定理支持的数值方案(从分子模型到连续介质力学,ARMA 164 341, 2002)。 The non-periodic real-space approach and the finite-element discretization of OFDFT from our first manuscript ("Non-periodic finite-element formulation of OFDFT") are key to developing this scheme.

I will be really happy to discuss more with you.

星期五,2007年3月2日15:39:51 +0000 Vikram Gavini 评论1424在https://imechanic万博manbetx平台a.org
很有趣 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1421#comment-1421

回复详细信息和应用

Vikram,

这很有趣。我确实注意到你的一篇论文出现在JMPS的“出版文章”部分。不受周期边界条件约束是很好的。

我有两个简单的问题:(1)您是否尝试过从电子结构的角度使用/测试您的方法来研究半导体簇(量子点)?(2)您是否在网上可用的准连续体代码中实现了您的工作?

2007年3月2日星期五13:20:37 +0000 Pradeep沙玛 评论1421在https://imechanic万博manbetx平台a.org 详情及申请 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1414#comment-1414

回复申请和详细信息< div class="field- name-comment-body field-type-text-long field-label-hidden">

亲爱的Henry Tan,

此作品尚未出版,但已在JMPS网站上作为文章出版。由于某些原因,我在帖子中的链接没有出现。我现在已经更新了我的帖子。我也在这里提供了这些论文的链接。

http://www.its.caltech.edu/~vikramg/academic/OFDFT-FE.pdf

http://www.its.caltech.edu/~vikramg/academic/DFT-FE-QC.jmps.pdf

关于这种方法的应用,有很多。这种方法的发展将量子力学和连续体长度尺度与密度泛函理论作为其唯一的物理理论无缝耦合,是计算材料性质的最可靠、计算上可行和可转移的理论。因此,从广义上讲,应用是从量子力学的角度来研究有缺陷的材料。目前,我主要研究两个方面的应用:(1)研究铝中空位聚集和棱柱环形成的问题,这从材料辐射损伤的角度来看是很重要的。我们在这里观察到了一些非常有趣的物理现象,这是以前没有观察到的(这项工作没有发表,所以我不能给你细节;(2)研究单个位错,解析所有长度尺度并计算核心能量。

The other examples which I can list are : computing migration energies of these defects, studying surface reconstructions, phase transformations in materials. Once we extend this approach to the Kohn-Sham version of density-functional theory, one can study how optical, electronic and magnetic properties of complex materials (like ferro-electric, photonics materials) get influenced by defects like surfaces, domain walls and others.

There have been attempts to study these problems before, which broadly fall under the category of multi-scale modeling. But all these approaches have used heterogeneous theories to describe features at different length scales and various hypothesis are used to stitch these heterogeneous theories across the boundaries. This work differs from those approaches in an important way. We use the same physics everywhere in the domain (OFDFT) and use the power of coarse-graining to seamlessly transition from quantum mechanical length scale to continuum length scales. So we keep the same fundamental physics everywhere in the domain and play with the numerics.

I will be really happy to discuss more if you are interested.

2007年3月2日星期五04:07:25 +0000 Vikram Gavini 评论1414在https://imechanic万博manbetx平台a.org
申请及详情 https://万博manbetx平台m.limpotrade.com/comment/1412#comment-1412 2007年3月2日星期五01:47:41 +0000 亨利·谭 评论1412在https://imechanic万博manbetx平台a.org